CB_banner_new.jpg
A <i>GDF6</i> gén és az evolúció

A GDF6 gén és az evolúció

2016.01.21. 20:52 dolphin

sticklebacks.jpegJó pár évvel ezelőtt, a blog hajnalán, az egyik legizgalmasabb és legfelkapottabb kérdés a biológiában az volt, hogy a különböző fajok (alfajok) morfológiai sajátosságai miképpen alakulnak ki a fejlődés során. Az evodevo tudománya - mert arról van szó - azóta kicsit kiment a mainstream divatból, de ha engem kérdezne bárki, szerintem továbbra is az egyik legizgalmasabb kérdés, amivel biológus foglalkozhat.

A terület egyik úttörője, Sean B. Carroll mellett David Kingsley volt, aki azóta is azzal a nagyon egyszerű paradigmával foglalkozik, hogy milyen genetikai különbségek találhatók a háromtüskés pikó páncélos, tüskés tengeri és páncéltalan, tüskétlen édesvízi formái között.

Ahogy azt már korábban leírtam, ezzel a megközelítéssel leltek arra a pitx1 szabályozó mutációra, ami a tüskék eltűnését eredményezi, illetve így térképezték fel csontlemezek redukciójáért felelős ectodysplasin (eda) gént érintő mutációt is.

Most egy újabb mutációt határoztak meg, ami az édesvízi halakban a kevesebb csontlemez kialakulásáért, illetve a meglevő lemezek méretének megváltozásáért felel.

gdf6-stickleback_1.jpegA klasszikus genetikai térképezés a gfd6 nevű gén közelében tette a mutációt, ami pont olyasmi, amit az ember találni szeretne: a Gdf6 fehérje ugyanis a BMP fehérjék csoportjába tartozik, amely rövidítés a Bone Morphogenetic Protein kifejezésből származik - azaz, már régóta tudjuk, hogy az ilyen típusú fehérjéknek szerepe van a csontok fejlődésében.

A mutáció megint egy szabályozó mutációnak bizonyult, ráadásul, ellentétben pl. a pitx1 esetével, amikor az édesvízi populációkban a gén egyik expressziós doménje elveszett, itt egy új expressziós domén megjelenésével állunk szemben: az édesvízi pikók megfelelő genomi régióját egy riportergén (pl. GFP) mögé téve a test teljes hosszában megfigyelhetünk expressziót a fejlődés egy korábbi szakaszában, olyan helyeken is, ahol a tengeri állatokban nem. Az oka ennek különleges (bár nem teljesen meglepő): egy ugrálóelem jelent meg az édesvízi pikók genomjában itt, és számos más példa alapján tudjuk, hogy ezek a mobilis genetikai elemek általában a génexpressziót elősegítő promótereket és enhancereket hurcolnak magukkal, amelyek elsősorban a saját genetikai anyaguk kifejezésére kellenek, de ha elég megengedő a genomi környezet, akkor a szomszédos génekre is hatással lehetnek.

Ami azonban a dolog legszebb bizonyítása, hogy ha ezzel az enhancerrel riportergén helyett GDF6-t hajtunk meg, és bevisszük tengeri fajokba, akkor nagyon hasonló elváltozást tapasztalunk, mint amit a tengeri -> édesvízi átmenet során az evolúció is produkált.gdf6-stickleback_2.jpegA történet azonban nem állt meg itt. Ahogy Kingsley-ék egy korábbi munkája bemutatta, gyakran a pikó-populációkban lezajló változások instruktívak lehetnek arra nézve, hogy mi is történik az emberi evolúcióban: sokszor analóg átmeneteket - pl. bőrszínváltozás - ugyanannak a génnek a különböző mutációi produkálnak.

Épp ezért, kapcsolódva egy másik munkájukhoz, amely során olyan potenciális enhancereket keresnek, amelyek az emlősökben (de legalább főemlősökben) nagyon konzerváltak, viszont belőlünk hiányoznak, megnézték, hogy az emberi GDF6 gén környékén találunk-e ilyen szakaszt. A válasz röviden az, hogy találunk, és lehet, hogy ennek az eltűnése lényeges lépése lehetett a Homo génusz evolúciójának.  

gdf6-chimp_1.jpeg

A szóbanforgó enhancer-jelölt (hCONDEL.306) ugyanis egy riportergénhez kapcsolva egerekben nagyon érdekes expressziós mintázatot mutatott: csak a test hátsó részében fejeződött ki, különösen erőteljesen a hátsó végtag ujjaiban. Ott mindenféle szövetben megtaláljuk, például a nagylábbujjak távolító izmában is, ami különösen felkeltette Kingsley-ék érdeklődését. Mégpedig azért, mert ez az izom az emberi evolúció során részben elsatnyult, hasonlóan bizonyos rágóizmokhoz. Utóbbiak esetében mára sikerült azonosítani a folyamat molekuláris hátterét (a MYH16 gén működésképtelenné válása) és valami hasonlót szerettek volna a GDF6 kapcsán Kingsley-ék elérni.  

gdf6-chimp_2.jpeg

Mivel itt nem egy pszeudogénesedésről van szó, hanem egy feltételezett szabályozó mutációról, ez sokkal körülményesebb, és nem is sikerült nekik minden kétséget kizáróan (ehhez kb. csimpánzokban kellene kiütni a specifikus enhancert és nézni, mi történik - nem pont az a kísérlet, amit etikailag meg lehetne igazán okolni, és akkor még a technikai nehézségekről nem is szóltunk). De, azért az expresszión túl még egy fontos dolgot talált a csoport, amivel alá lehet támasztani az általuk favorizált evolúciós szcenáriót: azokban az egerekben, ahol kiütik a Gdf6 gént meg lehet figyelni, hogy a hátsó végtag ujjainak csontjai rövidebbek lesznek. Ez pedig megint egy olyan változás, amit az ember vs. csimpánz vonzatban is megtalálunk. 

De ha elhisszük, ha nem a hCONDEL.306 történetét, azt aligha lehet elvitatni, hogy a gdf6 fontos szerepet játszik a tüskéspikók evolúciójában, hasonlóan a pitx1 és eda esetéhez. És már ez is pont elég lett volna, hogy foglalkozzunk vele :-).


Indjeian VB, Kingman GA, Jones FC, Guenther CA, Grimwood J, et al. (2016) Evolving New Skeletal Traits by cis-Regulatory Changes in Bone Morphogenetic Proteins. Cell doi: 10.1016/j.cell.2015.12.007.

6 komment homo sapiens human evolucio evodevo david kingsley Tovább
A GDF6 gén és az evolúció Tovább
Facebook Tumblr Tweet Pinterest Tetszik
0
6 komment

Ajánlott bejegyzések:

  • Mire jó a GMO? 39. - Nitrogénkötés Mire jó a GMO? 39. - Nitrogénkötés
  • Hogyan tervezzünk új antibiotikumot? Hogyan tervezzünk új antibiotikumot?
  • Dezinformációk - A génszerkesztés Dezinformációk - A génszerkesztés
  • A szárnyát, vagy a ... kopoltyúját A szárnyát, vagy a ... kopoltyúját
  • Dezinformációk a gyakorlatban: Secondary infektion Dezinformációk a gyakorlatban: Secondary infektion

A bejegyzés trackback címe:

https://criticalbiomass.blog.hu/api/trackback/id/tr258284298

Kommentek:

A hozzászólások a vonatkozó jogszabályok  értelmében felhasználói tartalomnak minősülnek, értük a szolgáltatás technikai  üzemeltetője semmilyen felelősséget nem vállal, azokat nem ellenőrzi. Kifogás esetén forduljon a blog szerkesztőjéhez. Részletek a  Felhasználási feltételekben és az adatvédelmi tájékoztatóban.

Szalay Miklós 2016.01.22. 12:32:09

Akit érdekel, az alábbi linken talál egy általános összefoglalót az evolúcióról, annak működéséről, sajátosságairól:

egyvilag.hu/temak.shtml#elet1

(A felső sorokat nézzétek a kép tetején. Több dokumentumról van szó. (Az evolúció általában, az evolúció logikája, tökéletlensége, és a kapcsolata a halandósággal.) Az írások doc és pdf formátumban tölthetők le. Ezek egyébként egy nagyobb mű darabjai, mely megpróbálja módszeresen, de azért érthetően elmagyarázni, hogyan működik a világ.)
Válasz erre 

I_Isti 2016.01.22. 12:32:12

"feltételezett szabályozó mutációról"
Véletlenül egy roppant bonyolult rendszerben, annak egy nagyon bonyolult részében - vagy alrendszerében - úgy történik változás, hogy az a rendszer ettől nem rosszabb, hanem jobb lesz. És _én_ vagyok a fanatikus, amikor kétségbe vonom az egész evolúciótanos marhaságot, és nem az a sok nagyonokos "tudós" - akit egyáltalán nem zavar, hogy önmagában ez a megalapozatlan "tudományos" feltételezés ellentmond a termodinamika második főtételének.
Válasz erre 

dolphin · http://adlibitum.hu 2016.01.22. 12:36:42

Már épp kezdtem aggódni, hogy kihalóban vannak a magyar kreacionisták, bár kicsit csalódottan látom a kreativitás totális hiányát, s hogy még mindig nem tudtak jobbat kitalálni, mint az általuk valójában nem értett termodinamika második főtételére való "hivatkozást". De tényleg skacok, volt közel tíz évetek valami eredetit kitalálni... :-(
Válasz erre 

I_Isti 2016.01.22. 12:49:04

@Szalay Miklós: NE a világ működését magyarázd el, hanem mondjuk azt, hogy miért nem gubancolódik össze a DNS?
Válasz erre 

DarthVader 2016.01.22. 13:12:36

@I_Isti:

Mert a teremtő - áldassék a neve - hajlandó volt másfél örökkévalóságnyi időt pazarolni arra, hogy néhány enzimmel annyit szarakodjon, hogy ilyen legyen a DNS. Mert eleinte kurvára összegubancolódott, úgyhogy tulajdonképpen hetek mentek el arra, hogy az első működő állatokat megteremtse, mert az első példányok rettentő nyomorultul néztek ki, egyiknek fél feje volt, egy csomónak eleje-hátulja egyformán nézett ki, és amelyiknek két segge volt az nem tudott enni, amelyiknek meg két feje az nem tudott kakálni, és igy a Genezis se 6 napig tartott, csak PR szempontok miatt a sajtója nem nagyon szellőztette. (A KGB elődje jött rá a dologra, és kezdte alkalmazni, mert a szovjetek is fellőttek vagy 6-8 rakétát, mire 3 küldetést hírül adtak.) De addig molyolt, amig meg nem oldotta.
(Egyébként haragszom rá, mert az emlős szaporodásbiológiát kiválóan abszolválta, viszont a fogzáson még dolgozhatott volna - legfeljebb vasárnap belehúz még egy kicsit, na mond már, énnekem is kell ügyelnem hétvégén - és akkor most nem kellene a fogpótlásra vagyonokat költeni. Mibe került volna neki olyan fogrendszert csinálni, mint a cápáknak? Szerintem vagy a haverok zavarták meg egy sörparti igéretével, vagy egyszerűen beleunt, de ezt totálisan összecsapta. )
Válasz erre 

aszterixagall 2016.01.23. 12:50:23

@I_Isti:

Mindegy, hogy milyen bonyolult a rendszer, a lényeg az, hogy van input (mutáció) és van output (fenotipikus változás). Mivel az evolúció nem gondolkodik, csak próbálgat - variálja az iputot és teszteli az outputot - ezért teljesen mindegy, hogy a kettő között mi zajlik le. Egy bizonyos input egyértelműen megfeletethető egy outputnak és ennyi elég. Az embriológia ez evolúció számara balck-box. Tudom, hogy nem intuitív a dolog, de kérlek próbál átgondolni.

A termodinamika második főtételének megsértése? Már nagyon sokán leírták, hogy miért nem sérül ez az élettel, ebbe most nem mennék bele.
Válasz erre 
Mégsem
Mégsem

Megjegyzés:
Facebook

Mijez

A Kritikus Biomassza egy főként biológusokból álló baráti társaság blogja, ahol megmondjuk a véleményünket mindenféle biológiával kapcsolatos témáról és nemcsak...

Keresés

impakták

Utolsó kommentek

  • Kovacs Nocraft Jozsefne: @Mesterséges Geci: Ahogy egy másik blogba küldött kommentemben írtam, lehetünk ló- és tehéntrágya nagyhatalom is, minek ipar ebbe az országba? Bár a tehén nem jó, mert sok metánt fingik a légkörbe... (2023.02.21. 20:59) Hogyan vernek át? A mérgezett víz esete
  • Sexcomb: @Mesterséges Geci: Eltűnt valamilyen hozzászólásod? Akkor? Az a cenzúra, hogy nincs cenzúra? Tehát neked van egy erős érzelmi alapállásod, amivel hogy ha nem egyeznek a valóság tényei, akkor inkább... (2023.02.21. 19:42) Hogyan vernek át? A mérgezett víz esete
  • Mesterséges Geci: @Sexcomb: gáz, ha ezt magyarázni kell. Cenzúra = csak az jelenhet meg, amit megengedek. Előmoderáció... lássuk csak... ja, igen, ez pontosan az. Ennél már csak az a nagyobb gáz, ahogy ezt itt a blo... (2023.02.21. 19:37) Hogyan vernek át? A mérgezett víz esete
  • Mesterséges Geci: Ja, és (lásd előző, még hivatkozni sem tudok rá) pont az Átlátszó hírhedt a félrevezető cikkei miat... Aham... a nemzethhy sajtóban, meg a fideSS propagandistái körében. (2023.02.21. 19:36) Hogyan vernek át? A mérgezett víz esete
  • Sexcomb: @Mesterséges Geci: Ha elolvastad volna, rájöttél volna, hogy erről egyáltalán nem szól. Milyen cenzúra? Moderáció azért kell, mert viszonylag gyakran akarnak hozzászólásnak álcázott potencianövelő... (2023.02.21. 18:10) Hogyan vernek át? A mérgezett víz esete
  • Utolsó 20

Friss topikok

  • Kovacs Nocraft Jozsefne: @Mesterséges Geci: Ahogy egy másik blogba küldött kommentemben írtam, lehetünk ló- és tehéntrágy... (2023.02.21. 20:59) Hogyan vernek át? A mérgezett víz esete
  • fuhur: Szerintem az áránál fontosabb kérdés a tű bisszahúzásának a hibaszázaléka. (2022.04.27. 18:53) L-SOMA a gyomorinjektáló kapszula
  • Untermensch4: @lpt1: "milyen érdekes ez a sok GMO-hülye, aki veled szembe jön az autópályán, nem?" Mikor Berta n... (2021.04.29. 21:41) Hogyan duplázhatnánk meg a magyar GDP -t?
  • Tony Multh: Kedves Kalmár Éva, azt kérdezem, hogy a kb 10 évvel korábbi cíkke óta miként látja ma, 2021-ben a ... (2021.03.25. 18:55) Ketogén diétával a rák ellen?
  • glantos70: Érdekes cikk, köszi! (2021.03.05. 21:05) Miért egyenlőtlen a Lyme-kór fertőzések eloszlása?

Facebook

Tovább a Facebook-ra

YouTube csatorna

Címkék

#geekemberek (1) abiogenezis (2) adathordozás (1) adhd (1) agouti (3) agy (5) aids (2) alex (1) alkohol (3) áltudományok (6) alvas (1) anatómia (10) antibiotikum (9) antidepresszáns (1) antipszichotikum (1) antitest (1) anyatej (1) archeogenetika (2) astyanax (4) atavizmus (1) autofágia (1) baktérium (11) ben goldacre (4) biobulvár (56) biodizájn (11) biohacking (2) biokémia (3) biotechnológia (10) biotrial (1) bmp (1) bőr (1) bt toxin (11) burgess shale (1) cannabis (1) carl zimmer (1) cb10 (11) cb10-retro (3) cc-by 4.0 (1) chemoton (1) cichlid (1) cliff tabin (1) craig venter (3) CRISPR (12) csalánozók (1) csigák (1) csokeveny szervek (13) ctvt (1) cukorbetegség (1) daganatok (5) david kingsley (6) deextinkció (2) denevér (4) denisova (3) devbio101 (12) dezinformáció (3) diybio (1) DNS (17) dohanyzas (1) domesztikáció (3) dopping (1) Drosophila (1) ebola (2) ediakara fauna (2) élethossz (1) élet és tudomány (72) elsevier (1) embryo (10) endocannabinoid (1) epigenetika (3) értelmes tervezés (13) értem (12) érzékelés (1) etika (1) evodevo (86) evolúció (12) evolucio (168) exobiológia (1) fajképződés (4) fehérje (4) fejlábúak (2) fgf (1) filmkritika (2) first peoples (2) flagellum (2) fossziliák (25) fotók (1) foxp2 (5) gene-drive (1) génexpresszió (8) genomok (13) gensebeszet (79) génterápia (4) george church (10) geospiza (2) gépház (3) gmo vita (112) gomba (9) greenpeace (10) gyógyszerkísérlet (7) h1n1 (1) hal (1) halak (2) hangya (1) háziasítás (7) hgt (10) hiv (3) homeopatia (5) homo floresiensis (5) homo naledi (1) homo neanderthalis (13) homo sapiens (6) hox (19) hülyeség (3) human (49) idegelettan (8) illúziók (1) immun (9) impakták (11) influenza (1) intelligens tervezés (15) intelligent design (15) ismeretterjesztés (3) járvány (7) kabóca (1) karotenoid (1) kérészek (1) ketogén diéta (1) kettős hélix (1) kettős spirál (1) kezdőknek (5) kitlg (2) klíma (4) kolónia (1) konvergens evolúció (4) könyvajánló (16) környezetvédelem (6) kozmetika (1) kreacionizmus (17) kromoszómák (1) kutya (14) lamarck (1) látás (4) lebontó folyamatok (1) lovak (4) lúgosítás (2) macska (5) madar (2) magnetorecepció (1) malária (1) malaria (1) mamut (3) march for science (1) matemorfózis (1) mc1r (11) meetup (34) melanizmus (1) membracidae (1) méreg (3) mezőgazdaság (1) mikrobiológia (19) mikrobióm (2) mikroRNS (3) mimikri (1) mintázatok (18) modszerek (3) molekuláris gasztronómia (19) mooc (4) mosaicscience (2) mta (3) műanyag (2) myostatin (2) négyes hélix (1) neil shubin (2) neurobiológia (4) nipam patel (1) nobel díj (7) növénybiológia (4) nyelvkészség (1) ökológia (3) olimpia (1) oltások (10) oltványozás (3) ölveczky bence (1) onthophagus (4) opszin (4) optogenetika (1) öregedés (3) organoid (1) öröklődés (13) orvoslás (3) őssejt (9) oxitec (1) paleontológia (1) paleo diéta (6) papagáj (2) parabiózis (1) paraziták (4) peromyscus (3) peter grant (2) pettyesaraszoló (2) pigmentáció (1) pinty (6) placebo (1) polio (2) probiotikum (1) pszeudogének (7) pszichedelikumok (1) pterosaurus (1) puhatestűek (2) ragályos rák (1) rákkutatás (17) rasszizmus (3) regeneráció (2) rendezetlen fehérjék (1) rendszertan (1) retrogén (5) richard lenski (4) RNS (5) rosemary grant (2) rovarok (1) sarlatánok (3) SARS-CoV-2 (1) sean b carroll (2) sejtosztódás (2) shh (1) shinja jamanaka (1) shinya yamanaka (1) snowball (2) specáció (1) steve horvath (1) sügérek (2) szekvenálás (1) szem (14) szendi gábor (6) szépségipar (1) szex determináció (3) szimuláció (1) szintetikus biológia (3) szúnyogok (1) tájékozódás (1) tánc (2) táplálkozástudomány (18) tarsadalom (8) TDCS (1) természetfilm (1) tiktaalik (1) tim hunt (1) többsejtűség (2) toxoplasma (3) transzpozon (3) tudkom (11) tudomány történet (8) tudpol (15) tükörteszt (4) tüskéspikó (3) űrkutatás (1) végtagfejlődés (3) velőléc (1) vércsoportok (1) vírusok (3) viselkedés (7) werner szindróma (1) wnt (1) wolbachia (7) zika (1) Címkefelhő

Archívum

  • 2023 február (1)
  • 2022 május (1)
  • 2022 február (2)
  • 2021 március (2)
  • 2021 február (3)
  • 2020 december (1)
  • 2020 október (1)
  • 2020 augusztus (2)
  • 2020 július (7)
  • 2020 június (4)
  • 2020 május (3)
  • Tovább...

Feedek

  • RSS 2.0
    bejegyzések, kommentek
  • Atom
    bejegyzések, kommentek
XML

Creative Commons

Creative Commons Licenc

Egyéb

evolúció, biológia, genetika, fejlődéstan, kreacionizmus, intelligent design, intelligens tervezés, áltudományok, biology, genetics, evolution
süti beállítások módosítása